Obsah

• Obsah: Rozdiel medzi knižnicou Genomic a knižnicou cDNA
• Porovnávacia tabuľka
• Čo je to genomická knižnica?
• Čo je knižnica cDNA?
• Kľúčové rozdiely

Genomická knižnica aj knižnica cDNA sa používajú pri klonovaní génov na izoláciu rôznych DNA. Rozdiel medzi oboma týmito knižnicami je v tom, že genomická knižnica obsahuje fragmenty DNA, ktoré exprimujú celý genóm organizmu, zatiaľ čo v knižnici cDNA sa mRNA vyberie z konkrétnych buniek organizmu a potom cDNA pozostáva z tejto mRNA v reakcii, ktorá je katalyzovaná pomocou enzýmu.

Obsah: Rozdiel medzi knižnicou Genomic a knižnicou cDNA

• Porovnávacia tabuľka
• Čo je to genomická knižnica?
• Čo je knižnica cDNA?
• Kľúčové rozdiely

Porovnávacia tabuľka

základ	Genomic Library	cDNA knižnica
definícia	Genomická knižnica je zbierka kompletnej genomickej DNA z jedného organizmu. DNA je uložená v populácii podobných vektorov, pričom každý obsahuje odlišný inzert DNA.	CDNA knižnica je zmes klonovaných cDNA fragmentov vložených do výberu hostiteľských buniek, ktoré spoločne tvoria časť transkriptu organizmu.
vyjadrenie	Celý genóm	Iba špecifické gény.
veľkosť	väčšia	menšie
IntronA	prúd	neprítomný
vektor	Využíva plazmidy, kozmid, fág lambda, YAC a BAC na umiestnenie veľkých fragmentov.	Nie sú to žiadne intróny, takže využíva plazmidy, fagemidy a fágy lambda na umiestnenie skromných fragmentov.

Čo je to genomická knižnica?

Pri postupe klonovania génov sa požadovaný gén kopíruje z DNA oddelenej od organizmu. Keď sa DNA oddelí od organizmu, boli gény extrahované naraz. DNA organizmu obsahuje tisíce rôznych génov. Genetický inžinier nájde jeden špecifický gén, ktorý kóduje konkrétny požadovaný proteín.

Neexistuje absolútne žiadna metóda, pomocou ktorej by bol konkrétny gén z DNA k dispozícii, takže vedci vytvárajú knižnice génov na katalogizáciu DNA organizmu. Vedci potom vyberú požadovaný gén do knižnice. Génová knižnica je skupina živých bakteriálnych kolónií, ktoré boli transformované jedinečnými kúskami DNA v organizme, z ktorého pochádza požadovaný gén. DNA sa extrahuje z organizmu, aby sa vytvorila knižnica, ktorá je organizovanou formou DNA. Genomická knižnica a cDNA sú dva druhy génových knižníc. Ako génové stratégie v rekombinantnej technológii sa použilo množstvo techník klonovania génov.

Fragmenty DNA sa oddelia odštiepením špecifickými reštrikčnými enzýmami z rodičovskej DNA. Tieto fragmenty sa ligujú do vektorových molekúl a nahromadené molekuly sa presunú do hostiteľských buniek, 1 molekula v každej bunke. Genomická knižnica sa skladá z intrónov, nezdravej DNA a množstva ďalších fragmentov. V tejto knižnici je DNA rozdelená na menšie fragmenty vo vnútri bunky. Potom sú všetky malé časti vložené do vektora, aby sa vytvorila knižnica. Genomová knižnica obsahuje celú DNA celých génov a bunka pozostáva zo všetkých svojich intrónov. Genomická DNA je translácia celého genómu. Nekóduje celú časť na jednom kodóne kvôli veľkosti intrónov. V genomickej knižnici neexistuje žiadny mechanizmus zostrihu, ktorý by spôsoboval ťažkosti s expresiou génov získaných z tejto knižnice.

Čo je knižnica cDNA?

Knižnica cDNA je vytvorená výberom jedného typu tkaniva alebo bunky. Následne sa z tohto tkaniva alebo bunky izoluje mRNA. Kópia DNA mRNA molekuly pozostáva zo špecifického enzýmu reverznej transkriptázy. Knižnica cDNA teda obsahuje špecifickú DNA, ktorá je prítomná v mRNA. V tejto knižnici sa nenašli žiadne intróny a žiadna sekvencia DNA. V tejto knižnici sú všetky klony v plnej dĺžke. Ďalej je klon cDNA nevyhnutný na transfekciu buniek na produkciu proteínov alebo na testy založené na bunkách.

Kľúčové rozdiely

1. Genomická knižnica bola napísaná priamo z genómovej DNA.
2. cDNA knižnica bola vytvorená s použitím mRNA ako templátu.
3. Genomická knižnica zaberá celý genóm tohto organizmu.
4. Knižnica cDNA predstavuje iba gény konkrétnych ochorení.
5. Pre konštrukciu genómovej knižnice sú dôležité dva enzýmy, reštrikčné endonukleázy a ligázy.
6. Enzým reverznej transkriptázy hrá významnú úlohu pri konštrukcii knižnice cDNA.
7. Genomická knižnica zaberá DNA prokaryotických aj eukaryotických organizmov.
8. cDNA knižnica predstavuje DNA práve eukaryotických organizmov.
9. cDNA knižnica je schopná genómovej expresie v baktériách, ktoré sú prokaryotické, pretože im chýbajú intróny.
10. Genómová knižnica nie je schopná povedať v prokaryotickom organizme, pretože má intróny a prokaryotický organizmus nemá stroje na spracovanie intrónov.